维吾尔族在历史上曾信仰过原始宗教、萨满教、袄教、道教、摩尼教、景教、佛教等，后来又信奉了伊斯兰教。

一、图腾崇拜时期

　　维吾尔族先民与世界上许多民族的先民一样，在科学技术极其落后的原始时期，对大自然中的许多现象及生长的万物无法理解，总认为有某种神灵起作用，因而便有了对这些自然现象如对一些动植物的崇拜。现在维吾尔族虽然早已信奉了伊斯兰教，但还保留了不少自然崇拜，即原始宗教的遗迹。

　　据文献记载，《乌古斯传》中的乌古斯汗的号令中就有“让太阳做我们的旗”之语。古    代维吾尔人对日、月的崇拜在现代维吾尔人中仍有留存。如，朝太阳方向吐唾沫、大小便等都认为是罪过，一旦出现日蚀，人们敲打锅盆，或做布施、诵经，祈求太阳及早恢复原形等等。月亮在古代维吾尔人的心目中占有重要地位，他们往往以月亮的盈虚变化为准，安排自己的活动，因而产生了对月亮崇拜的观念。据文献记载，维吾尔先民曾有礼拜月神的习俗。

　　现代维吾尔族中仍留存视月亮为神圣的遗俗，如不准朝月亮吐唾沫，不准朝月亮大小便，不能在月光下做秽亵之事等，因崇尚、喜爱月亮，人名、地名中亦多用“月亮”一词。古代维吾尔人对苍天、群星怀有神秘、喜爱的感觉，逐渐认识到星辰移动的规律，借以安排狩猎、游牧、农耕活动，认为星辰位置的变化预兆着人间的祸福，由此产生了对天体星辰崇拜的观念。

　　至今一些人仍认为地上有一个人，天上即有代表他的生命的一颗命星；那颗命星陨落，他就死了。在民间诗中，常把自己的心上人比做星星。日常生活中人们也常用星辰的名字给女孩子命名。

　　古代维吾尔人以植物为衣食来源之一，视他们为“神圣”的。特别是对树木更这崇拜，把它们看做自己民族的始祖。《亦都护高昌王世勋碑》、《世界征服者史》、《乌古斯汗》和《神树母亲》等中外史料中，都有反映维吾尔族树木的记载。在现代维吾尔人中，仍然存在着崇拜树木及其他植物的遗俗。如院里、田边、路边的独树、特别地老树，不允许砍伐；人患了病，或妇女不孕，或有其他什么祈求，在某些“圣树”上挂各色布条，以求吉祥；对农作物，特别是粮食、面食品尤为崇敬，不许踩踏；用布片包上植物的茎叶、籽儿，做成符绦，念几句咒语，挂在小孩的脖子上或腋下、或摇篮上，以祛除病，等等。

　　维吾尔人至今把咸盐视为圣物，加以尊敬，求其保佑。这不仅是因为它在生活中不可缺少，更重要的是维吾尔人深信盐具有一种超自然的、与人们的命运处处相关的神力。

　　维吾尔人生活中许多习俗禁忌都与此信仰有关，如让新结婚的新郎和新娘各吃一块在盐水里蘸过的馕以表示同甘共苦、永结良缘，人们发誓言时常说“以盐为证”等。

二、前伊斯兰教时期

　　在信仰伊斯兰教之前，维吾尔族历史上还曾信仰过萨满教、袄教、道教、摩尼教、景教、佛教、等多种宗教。

　　维吾尔族祖先曾信仰过萨满教。“萨满”一词为满——通古斯语，因满——通古斯语族各部落称巫师为“萨满”而得名。萨满教作为一种宗教信仰，虽然为维吾尔族后来所放弃，但它的影响还一直保留到今天。维吾尔族民间为人驱邪治病、占卜、解梦、相面的“巴克西”和“皮尔洪”，也就是古时候的萨满，他们为人祛病消灾时跳的“皮尔洪”舞，实际上就是古代的萨满跳神舞。

　　袄教即琐罗亚斯德教，我国俗称“拜火教”袄教在波斯萨珊王朝定为国教之后，开始向西域传播，大约在公元前4世纪传入今新疆地区。回鹘自漠北西迁后，亦同时崇奉袄教。

　　唐代以后，袄教在新疆虽呈衰落之势，但一直到伊斯兰教传入新疆后，袄教才退出历史舞台，其遗风仍然存在于维吾尔族民间。如新郎、新娘结婚这天要跳过或绕过火堆以避邪气，可能就是袄教遗风。

　　维吾尔先民信仰道教的历史大约可以追溯到公元5世纪。从现在新疆吐鲁番、哈密等地区出土的道教文物看，公元5世纪，道教确已在高昌维吾尔先民中传播。经唐至宋元，西迁的回鹘中已有不少人信仰道教了。

　　摩尼教地伊朗古代宗教之一，由伊朗人摩尼所创。该教在6-7世纪时传入新疆，并进而传入当时尚居住在漠北的回鹘部落中，并于公元762年之后成为回鹘的国教。回鹘西迁后仍一度保持摩尼教信仰，不仅大兴摩尼教寺院，而且以回鹘文大量译写摩尼教经典。直到15世纪伊斯兰教传播到吐鲁番地区以后，摩尼教才在维吾尔族中逐渐消亡。

　　景教，即基督教之聂斯脱利派，为叙利亚人聂斯脱利所建，与基督教正统教义大相径庭，创始人被逐，其信徙在受迫害而逃亡中将该教派传播到东方，并由新疆传到内地。宋末元初景教在维吾尔族中发展到十分兴盛的地步。维吾尔族聚居区域景教教堂广有分布，并同本地民族风俗相融合。

　　维吾尔族的佛教信仰是在回鹘西迁之后接受的，并且逐渐渗透到维吾尔族的政治、经济、文化等各个领域，成为维吾尔族当时主要的宗教。此前佛教早已盛行于西域。现新疆境内的龟兹、疏勒、于阗、高昌是佛教活动的中心，产生了辉煌的佛教石窟艺术文化，出现过摩罗什、佛图澄、裴慧琳等著名佛学大师。作为维吾尔族先民的回鹘人在西迁之后受到佛教广泛、深刻的影响。皈依佛门的回鹘人用回鹘文书写了丰富的佛教典籍文献，并与内地佛教文化发生密切的联系。

　　元代，西迁的畏兀人中更出现过阿鲁萨浑里、迦鲁纳答思、安藏、必兰纳识里、全兰八哈石等著名佛教高僧人森古萨里等佛经翻译大师。

三、伊斯兰教时期

　　伊斯兰教在维吾尔族中的传播、发展已有一千多年的历史。伊斯兰教早在唐代即开始传入新疆，大约在15世纪，伊斯兰教最终取代其他各种信仰，而成为维吾尔族全民信仰的 宗教。从此，伊斯兰教对维吾尔族的经济、政治、文化和生活习俗等方面，均产生了深远的影响。

　　信仰伊斯兰教的维吾尔族群众大多数人属于正统的逊尼派，只有一部分人信仰苏菲派教义，在新疆称为依禅派，此外还有少数人信仰什叶派教义。在宗教信仰活动上，各派一直保持着不同的宗教主张、仪式和特征。

　　维吾尔族信仰伊斯兰教，主要表现在信仰者的思想、行为都要严格以《古兰经》、《圣训》和其他宗教经典为准则。

　　他们笃信安拉和安拉的使者穆罕默德，相信安拉是宇宙万物独一无二的万能的主宰，严守“沙里亚”（伊斯兰教教法），相信末日和未来，注重五功（念、礼、斋、课、朝）。对维吾尔族教徙来说，清真寺是被伊斯兰教看作“神圣”的地方，是宗教组织活动的中心。除了作礼拜外，清真寺还兼作社会活动场所，维吾尔族地区到处都可见到建筑漂亮、宏伟的清真寺。在新疆，尤其是在维吾尔族聚居的南疆，大大小小的清真寺遍布城乡。

　　麻扎朝拜在维吾尔族伊斯兰教徙生活中也占有一定的地位。在穆斯林最集中的南疆地区，尤其是农村，麻扎朝拜尤为盛行，已经成为穆斯林宗教生活的一项重要内容。麻扎，意为“圣地”、“圣徙墓”。朝拜者相信麻扎具有神性，并把朝拜麻扎视为是一项宗教功修，认为能够代替去麦加朝觐。

　　凡路经麻扎的行人一般都要停下来，面对麻扎祈祷。从麻扎朝拜祈祷的内容和形式看，一个共同的特点是祈求神灵的佑助，以求神灵佑助免除灾祸和祈求幸福、祈求应验、祈求降雨、祈求 赐子、祈求解除病痛等。麻扎朝拜实质上是坟墓崇拜、祖先崇拜和多神崇拜的遗留和发展，是伊斯兰教与维吾尔等民族原始宗教信仰的传统文化相结合的产物。

　　过去，在维吾尔族地区还设有宗教法庭，处理本民族中的各种民事纠纷和各种刑事案件。维吾尔族从喀喇汗朝时代开始建立穆斯林法庭，严格推行伊斯兰教法典“沙里亚”。

　　新中国成立前，维吾尔人聚居的每个县里，都有一个宗教法庭，成为上层封建宗教人士统治广大维吾尔群众的重要工具。

　　过去，伊斯兰教不仅作为一种宗教，同时也作为一种社会制度、生活方式和文化表现形式，广泛地渗透到维吾尔族的精神生活和社会生活之中，给维吾尔族政治、经济、教育、伦理、语言文字、风俗习惯、文化艺术等方面以广泛深刻的影响。人们的生老病死，婚丧嫁娶，遗产分配、饮食、节日礼仪等等无不按伊斯兰教法规办理。伊斯兰文化成为维吾尔社会传统文化的重要组成部分。

　　解放后，党和政府实行政、教分离的政策，禁止伊斯兰教干涉政治活动和经济活动，禁止伊斯兰教人士干预人们的教育、婚姻等日常活动，同时宣传广大群众有信教和不信教的自由，伊斯兰教在广大维吾尔群众中的影响已有所减弱。